Beberapa ribu tahun setelah fenomena misterius yang mengubah seluruh umat manusia menjadi batu, Senku Ishigami, seorang anak laki-laki yang luar biasa cerdas dan berorientasi pada sains, terbangun.

Menghadapi dunia batu dan keruntuhan total peradaban, Senku memutuskan untuk menggunakan sains untuk membangun kembali dunia. Dimulai dengan teman masa kecilnya yang super kuat, Taiju Oki, yang terbangun pada waktu yang sama, mereka akan mulai membangun kembali peradaban dari nol...

Menggambarkan dua juta tahun sejarah sains dari Zaman Batu hingga masa kini, kisah petualangan yang belum pernah terjadi sebelumnya akan segera dimulai!